軌道式集裝箱門式起重機除起升機構有其特殊選擇外，小車運行機構和大車運行機構與其他橋式、門式類型起重機機構基本相同。
(1)起升機構。起升機構有兩種形式，鋼絲繩卷筒式與輪胎式集裝箱門式起重機的起升機構基本相同；而剛性伸縮式起升機構又類似于鋼廠冶金用夾鉗橋式起重機的起升機構。
①鋼絲繩卷簡類型起升機構由直流或交流電動機、齒輪聯軸器、盤式或塊式制動器，中硬齒面減速器、減速器與卷筒之間的齒輪聯軸器、雙聯卷筒和軸承座組成。由起升鋼絲繩、滑輪與吊具滑輪組組成一組繞繩系統。
②剛性伸縮式起升機構可以是用鋼絲繩卷筒提升機構；液壓油缸提升機構；平衡重齒輪齒條提升機構加上伸縮導向鋼結構架組成。鋼絲繩卷筒提升機構構造簡單，基本組成與其他起升機構相似．由于鋼結構具有一定的剛性，所以提升機構亦可分為兩組，有利于布置。液壓油缸提升機構工作平衡、構造簡單，但維護保養(yǎng)要求較高。
(2)小車運行機構。小車運行機構由直流或交流電動機、齒輪聯軸器、塊式或盤式制動器、中硬齒面減速器、低速齒輪連軸器和車輪及車輪支承組成。驅動機構的布置方式一般分為沿小車軌道方向布置和垂直于小車軌道方向布置兩種方式。驅動車輪的數量根據驅動不打滑的條件確定．現代設計基本采用全驅動。
(3)大車運行機構。大車運行機構通常采用三輪或四輪臺車，根據輪壓大小來確定。運行機構的構造和形式與其他各類起重機相似，如采用開式齒輪驅動臺車，則由直流或交流電動機、齒輪聯軸器、制動器、中硬齒面減速器、開式齒輪、車輪和車輪支承組成；如采用封閉性傳動，則將減速器輸出軸直接與車輪軸連接，直接傳動，但減速器傳動比將稍大。
由于大車運行速度較快，為防止起制動時車輪打滑，一般選用調速性能好的晶閘管直流調壓調速、交流變頻調速、交流定子調速等電氣控制系統。